Второй уровень контроля заложен в устройстве управления приводами спектрографа. Его функции необходимы для координации взаимных перемещений приводов, и исключения аварий при некоректных командах управления взаимно-связаных устройств. На этом уровне реализуется первая (инженерная) ступень логики управления спектрографом. Внешними интерфейсами этого уровня являются ручной, с применением инженерного пульта и програмный, с управлением от микро-РС.
Третий, высший, уровень контроля и управления исполнительными устройствами спектрографа реализован на програмном уровне в микро-РС. Он обеспечивает реализацию глобальных функций тестирования, калибровки, и управления режимами при эксплуатации спектрографа во время наблюдений на телескопе и в лабораторных условиях. Управление спектрографом с эторо уровня может производиться как с локального терминала микро-РС так и с удаленной машины, через последовательный Ethernet интерфейс.